Die Wort-Bild-Marke knüpft direkt an die reiche Tradition der Klosterinsel an und steht gleichzeitig für eine immer wiederkehrende Erneuerung und Weiterentwicklung: Die Knospe ist aus den kunstvollen Schriftzeichen der Reichenauer Malschule abgeleitet, ebenso die Farbe des Zeichens und der Schrift.
Der Kreis symbolisiert den ganzheitlichen Ansatz des Welterbes, dem die gesamte Insel mit ihrem geistigen, natürlichen und materiellen Erbe zugehören. Die unterbrochene Kreislinie steht für Öffnung und Dynamik, die dem Anspruch der Stiftung entsprechen: Vorhandenes bewahren, weitertragen und zugleich neue Impulse aufnehmen und setzen.